Nach einer Malerlehre studierte Werner Merzhäuser 1969-72 an der Fachhochschule (Werkkunstschule) Düsseldorf Grafik-Design.
1970 wurde er Mitglied der Arbeitsgemeinschaft Mülheimer Künstler. Zwischendurch gab es für ihn immer wieder Studienreisen durch Europa. 1976 wurde er als Druckgrafiker selbständig und zog in das Allgäu um. Im Jahre 1980 wurde Merzhäuser Mitglied im Berufsverband bildender Künstler Schwaben Süd. Von 1981 bis 1985 entstanden verschiedene Arbeiten mit Holz, denen sich Experimente mit Holzdruck anschlossen. Seit Ende der achtziger Jahre verarbeitet er vorwiegend Papier zu Materialbildern. Ab 1989 ist die Druckgrafik bevorzugte Ausdrucksmittel, es entstehen neue Arbeiten – Holzdrucke und Farbradierungen in Auflagen oder als Einzeldrucke.
